一、Cworld是什么?
Cworld是对HiC数据进行处理分析的一款软件,是基于perl语言开发的。
二、安装步骤
1.安装克隆
使用git clone命令将Cworld下载到服务器上,地址:
https://github.com/dekkerlab/cworld-dekker.
如果git clone不成功,可先将安装包下载到本地,再通过winSCP传输到服务器上。
2.编译安装
代码如下:
cd cworld-dekker
perl Build.PL
./Build
./Build install --install_base ~/home/biocon/perl5/lib/perl5
#安装的路径要在perl5目录下,当然不止这一个路径可以,还有很多,我最初安装在了工作目录下,结果在运行Cworld的perl脚本时报错。
报错的情形如上图所示,应该是说没有安装dekker这个模块吧,如果你们也遇到这种情况,仅需将安装好的cworld文件夹mv到以上任意路径下即可解决。