SNP (Single Nucleotide Polymorphism), SNV ( single nucleotide variants ) , Indel (insertion-deletion
SNP (Single Nucleotide Polymorphism):强调在一个群体中具有一定频率的变异,一般为二态性。比如G→C
SNV ( single nucleotide variants ) :包含多种单核苷酸变异,比如该位点可能由T变C,也可能由T变A。则T→C,A。SNV并没有强调在一个群体中具有一定的频率。
Indel (insertion-deletion) :插入和缺失,涉及多个核苷酸的改变,插入:G→GTC, 缺失:GTC→G
“SNV”是指单碱基变异,也称du为点突变;“SNP”是指单核苷酸多态性。SNV与NP的区别如下:
一、性质不同
SNV:SNV是一种由shu单个碱基改变发生的突变。
SNP:SNP是一种DNA序列多态性。
二、产生原因不同
SNV:SNV的产生原因是碱基替换、单碱基插入或碱基缺失等。
SNP:SNP的产生原因是在基因组水平上由单个核苷酸的变异。
三、影响因素不同
SNV:SNV的影响因素包括物理因素、化学因素,例如紫外线、伦琴射线等。
SNP:SNP的影响因素包括单碱基变异、转录区非同义突变、基因组分布不均等。
参考资料来源:百度百科-单核苷酸多态性
百度百科-单碱基变异