在线作图丨做一张叠加mantel test的相关性热图

本文介绍了如何使用云图图网站在线制作Mantel test和相关性热图的组合图,详细阐述了上传数据文件、设置参数和下载编辑图片的步骤,并提供了操作建议。
摘要由CSDN通过智能技术生成

下边这张图摘自2015年的Science(暂且叫他Mantel test和相关性热图的组合图吧),这张图在各大论坛都有R语言的教程,今天小编教大家如何不使用R语言,分分钟在线做出这样的高水平图片。参考文献:Structure and function of the global ocean microbiome (Fig. 5B).

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Q1:什么是Mantel test?
Mantel test分析对两个矩阵相关关系进行检验。)可以Mantel test 多用在生态学上,用来检验群落距离矩阵(如 Bray-Curtis distance matrix)和环境变量距离矩阵(如 pH, 温度 或者地理位置的差异矩阵)之间的相关性(Spearman 系数。Mantel test的相关性系数越大,p值越小,则说明环境因子对微生物群落的影响越大。同时,mantel test的偏分析(partial Mantel test等)可排除环境因子之间自相关的干扰。

Q2:如何在线做一个Mantel test和热图的组合图?
作图小网站——云图图(www.cloudtutu.com),操作步骤如下:
①登录网址:www.cloudtutu.com(推荐使用360或者谷歌浏览器)
②输入用户名和密码(小编已经为大家填好了),输入验证码后即可登录;
③登录后在工具一栏(高级分析)里找到Mantel test分析,点击进入;
④请按照界面右侧的说明书或者下文进行操作&#x

Mantel test是一种用于计算两个相关性矩阵之间相关性的统计检验方法,它用于判断两个矩阵之间的关联是否存在显著性。mantel test python包则是用于在Python编程语言中进行Mantel test的工具包。 mantel test python包通常提供了实现Mantel test所需的函数和方法。使用这个工具包,我们可以将两个相关性矩阵作为输入,并计算它们之间的相关性,并给出相关性的检验结果。根据结果,我们可以判断两个矩阵之间的相关性是否具有统计显著性。 在使用mantel test python包时,通常需要先导入相应的库,例如scipy和numpy。然后,我们可以使用这些库中的函数来计算相关性矩阵,并使用mantel test函数来执行Mantel test。根据具体的使用情况,我们可以指定两个矩阵的类型(如距离矩阵或相关系数矩阵)、相关性的计算方法以及显著性水平。 值得注意的是,mantel test python包不仅仅适用于基础的Mantel test,它还常常提供了其他变种的相关性检验方法,如Partial Mantel test和Pearson Mantel test等。这些方法可以处理更复杂的相关性分析问题,增加了在实际问题中的应用范围。 总结来说,mantel test python包是用于在Python中进行Mantel test的工具包,它提供了计算相关性矩阵并执行相关性检验的函数和方法。使用mantel test python包,我们可以判断两个矩阵之间的相关性是否显著,并进行更复杂的相关性分析
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