下边这张图摘自2015年的Science(暂且叫他Mantel test和相关性热图的组合图吧),这张图在各大论坛都有R语言的教程,今天小编教大家如何不使用R语言,分分钟在线做出这样的高水平图片。参考文献:Structure and function of the global ocean microbiome (Fig. 5B).
Q1:什么是Mantel test?
Mantel test分析对两个矩阵相关关系进行检验。)可以Mantel test 多用在生态学上,用来检验群落距离矩阵(如 Bray-Curtis distance matrix)和环境变量距离矩阵(如 pH, 温度 或者地理位置的差异矩阵)之间的相关性(Spearman 系数。Mantel test的相关性系数越大,p值越小,则说明环境因子对微生物群落的影响越大。同时,mantel test的偏分析(partial Mantel test等)可排除环境因子之间自相关的干扰。
Q2:如何在线做一个Mantel test和热图的组合图?
作图小网站——云图图(www.cloudtutu.com),操作步骤如下:
①登录网址:www.cloudtutu.com(推荐使用360或者谷歌浏览器)
②输入用户名和密码(小编已经为大家填好了),输入验证码后即可登录;
③登录后在工具一栏(高级分析)里找到Mantel test分析,点击进入;
④请按照界面右侧的说明书或者下文进行操作&#x