十大肿瘤生信常用数据库,科研必备

1、TCGA

 

官网地址:  https://portal.gdc.cancer.gov/

小编认为虽然下载数据TCGA官网肯定不如CGDSR或者XENA，但是呢，它的信息最全，有很多稀奇古怪的临床指标都得从这下载。

 

除此之外，一些整体的样本情况，实验和对照信息，临床统计数据，也都一目了然。

 

2、GEPIA  

官网地址:  http://gepia2.cancer-pku.cn/#index

现在工具版本升级到2了，这个支持TCGA所有的样本基因的差异分析，预后分析。

 

GEPIA2还支持TCGA和GTEx联合分析，这对于提升差异的准确性相当友好。如果你的课题涉及到了TCGA数据基因的表达和预后，可以选择这个工具，事半功倍哦。

 

3、cbioportal  

官网地址:  https://www.cbioportal.org/

下载TCGA的突变数据firebrowse或者xena效果更好，但是对突变数据整体评估，单个基因突变预后分析，这个工具更优秀。

 

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