gtfToGenePred使用问题记录

ucsc的 gtfToGenePred 软件认为在GTF注释的转录本号相同，就是一个转录本，而这些转录本的位置必须相同，而在GTF中不同基因有多个转录本，这些转录本是不同的但是却没有反应在记录的转录本号上，这些都是同一个转录本，但是在不同的染色体的不同位置。所以程序报错，说同一个转录本必须是在相同的链上，相同的序列。需要处理GTF的转录本信息。hg38.gtf有这个问题，而hg19没有这个问题。