blast安装（无root权限不联网不配置环境变量）

最新推荐文章于 2024-02-21 21:11:57 发布
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分类专栏： 软件编译安装 文章标签： linux
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版权

简介

BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较。BLAST结果中的得分是一种对相似性的统计说明。
BLAST发现生物学序列之间的相似区域。BLAST采用一种局部的算法获得两个序列中具有相似性的序列。该程序将核苷酸或蛋白质序列与序列数据库进行比较，并计算统计显着性。基本局部比对搜索工具（BLAST）查找序列之间的局部相似性区域。BLAST可用于推断序列之间的功能和进化关系，以及帮助鉴定基因家族的成员。

安装BLAST-2.6.0软件
详细步骤
（一）、blast-2.6.0
支持版本号：2.6.0 及以上
源码包位置：
/home/pct13/Blast
已经安装好的版本链接位置：
/home/pct13/Blast/blast
安装步骤：
涉及到的源码安装包：
ncbi-blast-2.6.0±x64-linux.tar.gz
1、编译安装blast-2.6.0

#解压缩  
tar -zxvf ncbi-blast-2.6.0+
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不想翻身的小咸鱼
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专栏目录
Windows本地安装Blast及使用
koyee的博客
06-26 4607
1.下载安装包https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 2.双击下载的安装包，如下所示表式安装成功 3.创建数据库文件夹并添加路径到环境变量 4.使用makeblastdb自定义参考基因组文件，例如这里创建hg19.fa，out为hg19 5.使用时候注意，-db的名字为上一步-out的名字，按照如下即可。 ...
Blast程序安装文件
11-27
Blast文档，适用于WINDOWS系统的Blast程序安装文件。非常适合初学者使用以及学习。
blast安装及简单使用
qq_35716085的博客
12-20 2万+
下载blast# 解压blast压缩包# 测试这里就代表安装成功了，但是执行命令就有点麻烦需要用全路径的blastp运行，如果想直接用blastp还需要安装另一个插件：这样安装成功之后才可以使用blastp命令。
Blast安装及使用-Blast+2.14.0（bioinfomatics tools-001）
最新发布
weixin_44874487的博客
02-21 2838
BLAST一般在国内生物信息学专业教材中数据库和序列比对相关章节，并且众多生物化学和分子生物学教材中基因组与比较基因组学相关内容也已单独成章。通过测序获得基因、甚至基因组序列，也已成为分子生物学实验室的常规实验方法。
本地blast安装使用教程
精通多种编程语言Hello World的编写
11-08 1万+
本地blast使用教程 一、 软件安装 1.下载地址：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.11.0/ 2.点击红框里的版本开始下载： 3.安装步骤： 查看是否安装成功（可以不操作，直接跳到到配置环境变量）： ① 找到自己安装的文件夹 ② 将上图红框的位置改为cmd，然后回车进入命令提示符 ③ 在命令提示符输入blastn –version，然后回车 回车之后显示下图则证明安装成功 二、 配置环境变量 如图所示建立
Blast+安装使用的简单流程
liduo159357的博客
03-16 1226
通过https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/LATEST/网站下载，并执行安装为了使用BLAST的数据库，需要建立一个文件夹储存它们。
blast-2.2.26-x64-linux
06-23
2. **配置环境**：将解压后的bin目录添加到系统PATH环境变量中，便于在任何位置运行BLAST命令。 3. **运行BLAST**：通过命令行界面，输入相应的BLAST命令及参数，如`blastn -query query.fasta -db db.fasta -out ...
BLAST 本地安装教程
09-26
BLAST 本地安装教程 windows 本地安装 BLAST
Windows下本地blast安装方法.docx
07-06
Windows下本地blast安装方法
blast.rar_blast_blast matlab_matlab blast
09-23
【标题】"blast.rar_blast_blast matlab_matlab blast" 暗示这是一个与“blast”相关的MATLAB仿真程序，可能涉及到爆炸力学或者冲击波分析。Blast通常指的是爆炸产生的冲击波，而在MATLAB环境下，这样的程序可能用于...
mpiBlast安装详解以及使用说明
网易搬砖选手
09-07 3617
Getting mpiblast   现在下载包文件：  wget http://www.mpiblast.org/downloads/files/mpiBLAST-1.6.0-pio.tgz  解压包文件：  tar xvzf mpiBLAST*.tgz  然后下载
Centos7.0 部署 GPU-BLAST
时光带来的礼物
08-30 983
    首先我们来认识几个词汇：   NIH（National Institutes of Health）美国国立卫生研究院；   NLM（National Library of Medicine）美国国立医学图书馆；   NCBI （National Center for Biotechnology Information）美国国立生物技术信息中心。   由于意识到信息计算机化过程方法...
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KeyarchOS的博客
01-23 1243
浪潮信息KOS是浪潮信息基于Linux Kernel、OpenAnolis等开源技术自主研发的一款服务器操作系统，支持x86、ARM等主流架构处理器，性能和稳定性居于行业领先地位，具备成熟的 CentOS 迁移和替换能力，可满足云计算、大数据、分布式存储、人工智能、边缘计算等应用场景需求。详细介绍见官网链接浪潮信息云峦服务器操作系统KeyarchOS-浪潮信息。BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。
linux 下安装blat软件
悠悠的博客
04-06 5209
linux 下安装blat软件 blat是一款很经典的比对工具，与blast相比，具有速度快、共线性输出比对结果等优点。但是，blat源码包里面的README文件写得很不清楚，这里，我来提供一份详细的安装文档。 0、下载地址：http://users.soe.ucsc.edu/~kent/src/ 1、解压 blastSrc.zip文件夹，并进入blastSrc；
Blast本地化：window平台下blast软件的安装
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02-09 1万+
1.对于windows 2000/xp 用户，下载blast-2.2.18-ia32-win32.exe安装文件 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/LATEST/blast-2.2.18-ia32-win32.exe 2.创建一个新目录，例如C:\blast，将下载的文件blast-2.2.18-ia32-win32.exe复制到该目录，
Linux上部署和使用Blast序列比对工具
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12-07 3773
第一步:Index of /blast/executables/blast+/LATESThttps://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/去这个网址,下载ncbi-blast-2.13.0+-x64-linux.tar.gz,也就是Linux版本第二步:在linux上创建好文件夹,比如我在/home下创建soft文件夹,用于安装Blast软件.第三步:把下载好的压缩包,放到文件夹下,进行解压,命令如:tar -zxvf ncbi-bl
这可能是最全最好的BLAST教程
xuzhougeng blog
09-02 6436
Basic local alignment search tool (BLAST) 包括：blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等. 使用conda安装即可。 conda install -c bioconda blast # blast安装perl模块的方法 conda install perl-digest-md5 B...
Linux下BLAST安装及BLAST使用
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宁生信
06-09 3万+
1、把BLAST的压缩文件解压，然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下； 2、制作软链接，将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下，eg：ln -s /home/username/blast/bin； 3、在当前用户目录下，编辑bashrc文件，在文件中加入export PATH=/home/username/bin/=$PATH;
Centos6.5系统下本地安装BLAST步骤
飘羽的博客
12-05 2663
1.NCBI上下载BLAST软件安装包： ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz 2.将压缩包放在自己指定的目录下，进行解压缩： tar -zxvf ncbi-blast-2.6.0+-x64-linux.tar.gz 3.解压完成后，配置环境变量： vi /etc/profile 添加内容： export BLAST_HOME=/h
非root用户安装blast
06-02
在Linux系统上，非root用户可以通过以下步骤安装Blast软件： 1. 创建一个新的目录，用于存放Blast软件和相关文件。可以在用户的主目录下创建一个名为"Blast"的文件夹。 ``` mkdir ~/Blast ``` 2. 下载Blast软件和数据库文件，可以使用wget命令下载。在本例中，我们将下载Blast+软件和NCBI的nt数据库文件。请注意，您需要查找最新版本的软件和数据库文件。 ``` cd ~/Blast wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.11.0+-x64-linux.tar.gz wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/nt.*.tar.gz ``` 3. 解压缩Blast软件和数据库文件。 ``` tar zxvf ncbi-blast-2.11.0+-x64-linux.tar.gz tar zxvf nt.*.tar.gz ``` 4. 将Blast软件的路径添加到用户的PATH环境变量中。打开~/.bashrc文件，并将以下行添加到文件的末尾。 ``` export PATH=$HOME/Blast/ncbi-blast-2.11.0+/bin:$PATH ``` 保存并关闭文件。运行以下命令使更改生效。 ``` source ~/.bashrc ``` 现在，非root用户就可以在自己的用户目录中安装和使用Blast软件了。

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