终于向作者要来了PPT,在动物大会上听了这个做GWAS的软件,一直想学习,今天作者回复了PPT内容,先分享一下。个人认为这款软件的特色:
1,可以进行多个随机因子的GWAS分析,比如重复力模型,窝别效应模型,母体效应模型,更符合育种的数据结构。
2,多性状GWAS分析模块(提升一因多效的检测功效,基因环境互作的GWAS分析)
3,纵向数据GWAS分析模块(比如测定日,随机回归模型,都可以进行GWAS分析了)
4,国内青年学者开发,中文说明文档,简单易用
飞哥在此立个Flag,好好学学这款软件,提升自己的分析技能。写一下使用教程。
软件地址:https://github.com/chaoning/GMAT
作者介绍:
宁超,山东农业大学动物科技学院副教授,硕士生导师。研究方向为数量遗传学和生物信息学,致力于全基因组关联分析和基因组选择方法研究,开发高效上位效应检验软件REMMA和纵向数据分析软件GMA,相关成果发表于Bioinformatics、Genetics Selection Evolution、Journal of Dairy Science等期刊。
下面是宁超老师2021年动物遗传育种大会的报告全文: