LncBase:lncRNA与miRNA相互作用数据库

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有非常多的文献报导指出，lncRNA可以作为miRNA sponge， 从而与miRNA发生相互作用。LncBase是一个专门记录lncRNA与miRNA相互作用的数据库，最新版本为v2, 网址如下

http://carolina.imis.athena-innovation.gr/diana_tools/web/index.php?r=lncbasev2%2Findex

分成实验证据支持和软件预测两部分结果，示意如下

实验证据支持的相互作用数据，主要是从文献中整理得到的结果，包括了qPCR, northern blot, reporter assay, CLIP-seq等检测方法，软件预测是通过DIANA-microT这个软件来实现的。其中软件预测的lncRNA与miRNA相互作用数据是可以免费下载的，实验证据支持的数据需要向开发团队申请才可以。

以实验证据支持的相互作用数据为例，在检索框输入miRNA和lncRNA的名字，可以检索二者之间是否存在相互作用

检索结果示意如下

点击右边的下拉按钮，可