odd ratio值在关联分析中的含义

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在GWAS分析中，利用卡方检验，费舍尔精确检等方法，通过判断p值是否显著，我们可以分析snp位点与疾病之间是否存在关联，然而这得到的仅仅是一个定性的结论，如果存在关联，其关联性究竟有多强呢？

很显然，我们需要一个量化指标来描述关联的强弱程度。类似于相关性检验，通过p值只能够说明两个变量是否相关。至于其相关性的大小，是正相关还是负相关，还需要结合相关系数来作出判断。在关联分析中的”相关系数”则对应两个常用的统计量， risk ratio和odd ratio。

以探究吸烟和肺癌之间的关联为例，基于的数据格式如下

	肺癌	正常个体
吸烟	a	b
不吸烟	c	d

risk ratio， 也叫做relative risk, 简写为RR, 通常称之为相对风险度，是暴露组的发病率与非暴露组的发病组的比值。对于上述数据，RR的计算过程如下

吸烟组患肺癌的比例 a / (a + b)

不吸烟组患肺癌的比例 c / (c + d)

RR  = (a / (a + b)) /( c / (c + d))

RR的数值大小直观的反映了暴露因素中发病率的大小，RR>1, 暴露组中发病率大于非暴露组的发病率，说明暴露因素和发病率是正相关关系，反之࿰