全基因组序列对比~mVISTA，perl转化mvista格式（图文教程）

最新推荐文章于 2024-11-27 23:01:42 发布
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分类专栏： 叶绿体基因组分析 文章标签： perl 开发语言
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版权

一、mVISTA的使用

首先，官方网址：https://genome.lbl.gov/vista/index.shtml

打开后如下，点击mVISTA

输入需要对比的序列个数

在对应位置输入自己的邮箱，上传目标序列的fasta格式文件 

这里有三个选项，LAGAN是多序列对比，Shuffle-LAGAN是检测重排

 在Name栏输入对应序列的名称，一般不能出现空格，可以用“-”代替

然后要上载文件，这里的文件格式要求必须是mvista格式的文件（要用perl语言转化，后续详细教程）

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