云平台教程 | 手把手教你科研实用绘图之Venn图

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爱基百客云平台小工具使用

首先，打开爱基百客官网：http://www.igenebook.com；点击菜单栏最右侧“云平台”按钮。

弹出云平台界面（下图），输入账号、密码和验证码方可登录；进入云平台，可以轻松实现多种组学数据的分析和可视化，实现真正的“零代码、无门槛、操作简单”！

登陆后，如下图，我们进入到小工具专栏。当前云平台已上线了32款小工具供大家使用，包括基础绘图，高级绘图，差异检验，聚类分析，序列处理等子模块，本着用户至上的理念，平台小工具将会持续更新维护，积极接受用户的反馈和意见。

1.1 

爱基百客云平台小工具科研常用绘图之Venn图

Venn图（Venn diagram）是一种用于展示两个或多个集合之间的关系的图形表示方法。它由英国逻辑学家和数学家约翰·Venn在1880年首次提出。Venn图的主要目的是通过两个或多个重叠的（椭）圆形区域来表示集合之间的交集、并集以及差异。每个（椭）圆形代表一个集合，圆形之间的重叠部分表示两个集合的交集，即同时属于这两个集合的元素。圆的一部分位于另一个圆之外表示该元素属于这个集合，但不属于另一个集合。

当生物信息学研究需要整合来自不同来源的数据时，Venn图可以帮助识别数据集之间的共同和独特元素，从而推进数据挖掘。不过，随着数据集的增加，Venn图的复杂度也会增加，如超过四集合Venn图对于人类视觉来说可能难以准确解释。在这种情况下，可以使用更复杂的图形表示方法，如upset图或者花瓣图。这两种图形爱基百客云平台均有提供可视化小工具。

爱基百客云平台Venn图可视化地址：http://124.71.149.47:5000/smalltools/detail?id=1675798338525478913。

下面我们进行韦恩图可视化实操练习。

首先点击小工具韦恩图

右侧的工具介绍对Venn图小工具的主要用途，使用方法以及结果解读做了详细的说明。左侧是必要的输入文件和参数选项。任务名称和任务编号系统会自动生成。后面可用于记录查看具体的任务。小工具提供了示例文件给用户做测试分析。同时，该页面还提供了一些常用参数调节选项。您也可进行自定义，后面将详细介绍。输出名自定义，默认Result。

1.2 

参数设置

输入文件：支持txt(制表符分隔)文本文件，以及Excel专用的xlsx格式，同样支持旧版Excel的xls(Excel 97-2003 )格式。

输入文件为各元素集合组成的表格。其中每一列代表一个集合，第一行表示集合的名称。如下表所示：

如果文件已经上传过，您可以直接点击选择按钮找到需要的文件勾选确定，无须再次上传。另外你可以根据自己的喜好选择不同的色系，输出名默认是result。

填写好上述所有的参数后，点击提交即可。

1.3 

任务查看

您可在任务管理栏中查看任务的运行情况和结果。默认情况下新任务将会在最上方展示。也可通过任务名、任务编码、日期点击查询，找到需要的任务。如下图：当状态成功时，表示任务成功结束。

点击下载按钮可直接打包下载全部结果。点击查看按钮可在线查看结果。

您可在在线查看结果后选择是否下载保存。另外如果结果较多时，结果展示区还可通过点击左侧或右侧的箭头进行图片切换。您可挑选自己感兴趣的结果图片进行下载保存。

1.4 

结果

输出结果包含pdf格式和png格式的Venn图以及交集元素表格。

1.4.1 

Venn图

也可根据自己的喜好换个配色试试。如使用”#e4c9b2”,“#f1c2a5”,“#f49d98”,“#fcd68f”这组粉色系。

1.4.2 

交集元素表格

交集元素表格如下表所示：

该表格总结了不同元素集合组合的计数和值信息。每行代表一种特定组合的状态。前面若干列代表的是输入的元素集合状态（TRUE 代表参与交集，FALSE代表的是不参与交集），倒数第二列是满足组合状态下的值，最后一列代表的是具体组合状态的交集元素。 如FALSE TRUE TRUE TRUE 1 AFLA_114050表示RNA_DOWN、ChIP_UP、ChIP_DOWN三组交集元素有一个，为AFLA_114050。