上图大家都不陌生,GSEA分析出来的一个结果图。这里想像大家介绍的不是这个图是什么意思,而是这个图换一种形式展示!
#安装R包
library(plyr)
library(ggplot2)
library(grid)
library(gridExtra)
#设置工作目录
setwd("C:\\Users\\lexb4\\Desktop\\singleGene\\21.multipleGSEA")
#获取目录下的所有xls文件
files=grep(".xls",dir(),value=T)
#读取每个文件
data = lapply(files,read.delim)
names(data) = files
该目录下的所有文件
以其中一个文件为例
dataSet = ldply(data, data.frame)
#将文件后缀删掉
dataSet$pathway = gsub(".xls