报错:进行多组富集分析可视化时遇到NA值作为独立组
xx <- compareCluster(gcSample,
fun = "enrichGO",
OrgDb = "org.Hs.eg.db",
pAdjustMethod = "BH",
pvalueCutoff = 0.05,
ont = "ALL"
)
dotplot(xx)
问题截图如上,最后面多了一个NA
组。
解决方案如下
dotplot
函数中添加参数 by='count'
或 by='GeneRatio'
:
dotplot(xx, by='count')
END~