宏基因组分箱 (Binning)分析流程，赠送代码和练习数据

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只做宏基因组太单调？为什么不试试宏基因组Binning呢？

宏基因组Binning

宏基因组分箱（Binning）是将宏基因组测序得到的混合了不同微生物的序列reads或序列组装得到的contigs或scaffolds按物种分开归类的过程。这些分开归类的序列被称为宏基因组组装基因组（metagenome-assembled genomes，MAGs)。

宏基因组分析VS Binning分析

      二者都是基于菌群样品的二代测序数据分析，都能进行物种、功能注释，统计学分析。宏基因组依赖数据库，适合常见样品的分析，适用于基于已知（数据库）寻找与感兴趣指标有关的细菌和功能基因。Binning常用于分析罕见样品中未知且有特殊用途的细菌，是一种更有意义、难度更大的探索性研究。

Binning的优势

免费分享Binning的整套分析流程

一次测序，“宏基因组”+“Binning”两种分析，微科盟帮您一站式处理宏基因组难题。现在，微科盟免费向所有人分享Binning的整套分析流程，包含：生信分析代码和R语言绘图代码。

编号	内容	可视化
1	介绍、报告展示	网页结题报告
2	质控、分箱、质检、可视化	Bin散点图
3	丰度计算、差异分析	丰度热图、柱形图、LDA图
4	COG  EC RNA注释统计	分类柱形图
5	KEGG  GO注释统计	通路图、分类柱形图
6	CAZyme注释统计	箱图、热图、堆叠图、饼图
7	进化分析、基因组圈图	进化树、Circos图

免费领取方法

联系您所添加的任一个微科盟组学老师即可，如未添加过微科盟组学老师，请添加多组学老师27，备注《Binning》即可领取全部课程的链接。

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讲 师 简 介

主讲人：胡老师（阿童木），毕业于浙江大学，有多年一线数据分析经验，擅长使用R、Python、Shell语言做生物信息学分析和统计分析，开发过多个生物信息分析流程，特别是扩增子测序数据分析、宏基因组测序数据分析、宏基因组Binning分析以及细菌基因组完成图分析。

部分课程PPT展示

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