Flye | 针对三代测序数据的基因组组装软件

最新推荐文章于 2024-09-07 09:13:12 发布

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分类专栏：生物信息文章标签：生物信息学

本文链接：https://blog.csdn.net/qq_50637636/article/details/122223105

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Flye是一款用于三代测序数据的基因组组装软件，它在Nature Biotechnology上发表于2019年。文章详细介绍了Flye的安装、测试数据下载、运行过程以及结果展示。此外，还探讨了数据过滤对结果的影响，包括NanoPlot质控、filtlong过滤，并通过quast评估组装质量。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

Flye

Flye是针对三代测序数据开发的基因组de novo组装的生信软件，于2019年发表在Nature Biotechnology上。

在这里插入图片描述

1. 软件安装

#利用conda安装
conda install flye
#编译安装
git clone https://github.com/fenderglass/Flye 
cd Flye
python setup.py install

flye --help
#输入上述命令查看是否成功安装，以下为该命令运行结果的一部分。

usage: flye (--pacbio-raw | --pacbio-corr | --pacbio-hifi

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