Flye
Flye是针对三代测序数据开发的基因组de novo组装的生信软件,于2019年发表在Nature Biotechnology上。
1. 软件安装
#利用conda安装
conda install flye
#编译安装
git clone https://github.com/fenderglass/Flye
cd Flye
python setup.py install
flye --help
#输入上述命令查看是否成功安装,以下为该命令运行结果的一部分。
usage: flye (--pacbio-raw | --pacbio-corr | --pacbio-hifi | --nano-raw |
--nano-corr | --nano-hq ) file1