2024.06.04【读书笔记】丨生物信息学与功能基因组学（第十章 多序列比对的基本概念与应用 第四部分）【AI测试版】

读书笔记：《生物信息学与功能基因组学》第十章（第四部分）

标题：多序列比对的实际操作与案例分析

实际操作案例

1. ClustalW和ClustalX：介绍了如何使用ClustalW进行网络多重比对，以及ClustalX的视窗界面操作。通过FASTA格式提交序列，使用“DoCompleteAlignment”命令产生多重比对，并可进一步手工编辑。
2. PileUp (GCG)：使用GCG包中的PileUp程序进行多重比对，允许调整空白罚分和延伸罚分，以及改变序列排列顺序。

多序列比对软件概览

• Dialign：适用于局部比对。
• MultAlin：位于法国Toulouse的INRA。
• Multiple Sequence Alignment version 2.0：位于GeneStream服务器。
• Musca：IBM的生物信息学小组开发。
• T-COFFEE：处理远缘蛋白时比ClustalW稍慢。
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