2024.06.03【读书笔记】丨生物信息学与功能基因组学（第十章 多序列比对的基本概念与应用 第一部分）【AI测试版】

读书笔记：《生物信息学与功能基因组学》第十章（第一部分）

标题：多序列比对的基本概念与应用

核心概念

1. 多序列比对的重要性：在生物信息学中，多序列比对是理解蛋白质或基因家族成员特征的重要工具。通过比对，可以揭示序列间的同源性，从而预测结构、功能和进化关系。
2. 序列家族：序列通常以家族形式存在，包括来自同一体内的相关基因（paralogs）、同一种群的变异体（polymorphic variants）或不同种群的基因（orthologs）。

多序列比对的定义

• 多序列比对涉及三个或更多蛋白质或核酸序列的对齐，其中相同或相似的氨基酸残基被排列在同一列上，假定这些残基在进化上是同源的，并且在三维结构中也占据相应的位置。

应用场景

1. 功能预测：如果一个蛋白质与已知功能的蛋白质同源，可以预测它可能具有相似的功能。
2. 数据库搜索结果分析：多序列比对可以更容易地显示保守残基和模体，有助于分析BLAST等数据库搜索结果。
3. cDNA克隆分析：多序列比对能够揭示cDNA克隆测序结果中的矛盾之处。
4. 物种数据分析：分析物种数据可以揭示生物学问题，如进化、结构和功能。

多序列比对的挑