使用vmd渲染并保存指定分辨率的图片

最新推荐文章于 2025-02-12 20:02:56 发布

药研猿

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准备TCL脚本文件

# 设置渲染分辨率为1920x1080,600dpi
render TachyonInternal out.tga width 1920 height 1080 dpi 600

# 启用抗锯齿选项
display antialias on

运行TCL

在这里插入图片描述

输入：

source render.tcl

在这里插入图片描述

使用Photoshop打开输出的out.tga文件并保存常用图片格式

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使用VMD中的Tachyon渲染出透明逼真的水盒子效果

mt811的博客

08-25

1万+

1.概述在本教程中将重点向你展示如何通过VMD中的Tachyon制作一个高质量的可视化图像。本文假设你对vmd有一定了解（最基本的打开载入分子即可）。关于vmd制作图像的快速入门中文教程，本例所使用的工具和示例文件请见文末。 2.工具链 2.1.Tychyon Tachyon是为了利用多个计算机核心的优势而编写的光线追踪程序，其运行速度非常快，可以利用多个CPU核心的优势，快速生成高质量的图像，一般来说，光线追踪渲染器使用逼真的照明模型，可以正确地模拟阴影，这种照明与传统的点光源照明和定向照明配合使用，增

VMD使用

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依次点击Graphics>>Colors...

VMD渲染高清图片

weixin_51982763的博客

12-21

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渲染完成后会生成一个.dat的文本文件，之后使用vmd自带的tachyon_WIN32.exe将dat文件渲染为高清图片。test.dat为需要渲染的dat文件名。

分子模拟||VMD图像保存实用教程

Allenkx的博客

08-21

3305

其实还可以通过直接将上述代码改变一下直接放入render command中，实现点击start rendering后直接渲染出图的功能。有的同学使用上述直接渲染的方法，渲染完找不到图了，那可能是没有在设置文件名时候点击Browse..设置存放路径。这里提醒一下，那个线程数没事可以不要设置，在windows10上面测试，发现设置了不如没设置的渲染快，而且中途会卡主程序几秒。，即可在VMD的目录下生成Tachyon渲染器的输入文件。点击此.dat文件运行即可得到渲染后的VMD.bmp。

VMD 对已经建好的模型进行图片输出

dabaicai_520的博客

04-17

6699

（此过程若是新的Rep中原子比老的Rep中的Rep原子大，则会覆盖，否则不会覆盖，那就需要删除老的Rep；7. 至于其他原子的颜色大小，键的粗细，都可以在Graphics Representations中进行更改，新的Rep中的参数之后比老的Rep中的参数大时才会覆盖之前的，OpenGL Display中显示的才会有相对应的改变，若是新Rep和老的Rep中的参数相同，虽然OpenGL Display 中也会有相对应的改变，但是如果调整分辨率时，可能会出现新老Rep混合的现象。

使用VMD可视化lammpsdata文件并渲染出图片简易教程

weixin_68049324的博客

11-28

805

Drawing Mrthod：CPK Resolution 50左右。输入 topo readlammpsdata **.dat。Selected Atoms 选择不同原子。第三栏加上命令中插入 -res 2560 1440。Material 选择不同材质。右上角Extensions---Tk Console。Display--Depth Cueing 关闭。第二栏设置图片文件名（一定要设置）VMD 绘制分子示意图--lammps。输入cd work_dir。

VMD教程：分子图形与环境设置保存

7. 输入图像文件名，例如"picture.tga"或"picture.dat"，指定保存渲染后的图像文件。此外，这个VMD教程还涵盖了分子图形表现的基础知识，包括如何创建逼真的图像。对于高级用户，它还介绍了VMD的脚本功能，这些...

VMD指导材料---美国伊利诺伊大学

05-09

#### 一、VMD简介及使用基础 ##### 1.1 加载分子 - **加载方法**：介绍如何通过VMD软件加载单个分子结构文件，通常支持PDB等格式。 - **操作步骤**：详细步骤包括打开VMD软件、选择“File”菜单中的“New”选项来...

【VMD技术优化指南】：性能提升与效率提升的核心策略

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VMD + TCL 渲染

Joe_yaoxiao的专栏

11-13

4156

小结在一个项目中用到了vmd ，这个工具功能很强大，可以把模拟一些分子的运动轨迹。开源的 openm 是个很好的工具，其中有的sample 可以产生 pdb 文件。然后通过 vmd 完美的渲染出来。这里做个小的总结，总结一些有用的东西，关于vmd 支持python 和tcl的拓展。 ug.pdf 即user guide 写的很详细，包括vmd 的使用和一些具体的tcl 命令。

VMD细碎知识点(3)

yin1331102028yin的博客

05-06

485

vmd命令

项目推荐：vmd - 实时预览Markdown文件的工具

gitblog_01270的博客

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2021-10-05

Mars936的博客

10-05

2597

CentOS 7下VMD的安装及.pdb文件的导出 VMD的安装 tar xzvf vmd-1.9.4a51.tar.gz cd vmd-1.9.4a51 ./configure cd src make install 碳纳米管为例导出.pdb文件 2.1 创建碳纳米管 2.2 调整碳纳米管，排列方式，直径与长度 2.3 在VMD main界面，右键点击显示的文件，选择save Coordinates… 根据需要选择Selected atoms和File type，然后Save…即可。 Ma

让分子在PPT里“动”起来

药研猿的博客

10-21

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很多时候我们在做presentation时，常常需要展示一些分子结构。通常情况下会采用组合多个视角的二维图的方式而尽可能多地展现分子结构细节，但这样做一方面很不直观，另一方面也不方便讲述。而做成动画视频或动图会是个不错的呈现方式，但这样往往会使得ppt文件变得臃肿庞大，随时面临死机的状况。此外一旦制作好不方便调整修改，对演讲者时间的把控能力也提出了更高要求。