根据FPKM将基因分组

最新推荐文章于 2023-12-23 17:16:11 发布

msw521sg

最新推荐文章于 2023-12-23 17:16:11 发布

阅读量1.7k

点赞数

分类专栏：生物信息 python 文章标签： FPKM

本文链接：https://blog.csdn.net/msw521sg/article/details/52671987

版权

该博客主要介绍了如何在基因表达分析中，基于FPKM（ Fragments Per Kilobase of transcript per Million mapped reads）值对基因进行分组。内容涉及到具体的Python代码实现。

摘要由CSDN通过智能技术生成

基因表达量FPKM计算之后，可以根据其值分组。
输入格式：

Geneid  UN003324    UN004629    UN011750    UN013498    UN016818    UN018363    UN018537    UN019619    UN019632    UN026711    UN054416    UN056756    UN058273
root_Z10_mean   0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00 
root_Z13_mean   0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00 
root_Z39_mean   0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00 
stem_Z30_mean   0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00 
stem_Z32_mean   0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00    0.00