组蛋白乳酸化和RNA甲基化如何联动？请大数据把这个思路推给科研人

在细胞生物学中，基因表达调控是决定细胞功能与命运的核心过程之一。组蛋白作为修饰性蛋白，在调控基因转录中起着至关重要的作用。近年来，科学家们发现，组蛋白的多种化学修饰（如甲基化、乙酰化、磷酸化等）影响基因的表达状态。其中，组蛋白乳酸化作为一种新近发现的修饰，引起了广泛关注。

组蛋白乳酸化是由代谢副产物乳酸直接调控的，这一过程不仅涉及组蛋白的结构改变，还可能对其功能起到调节作用。与此同时，RNA甲基化作为一种重要的转录后修饰，已经被证明在调控基因表达、RNA稳定性和翻译效率等方面起着关键作用。RNA甲基化的变化对细胞的代谢状态、发育过程以及肿瘤形成等诸多生物学进程产生深远影响。

最近一些研究表明，组蛋白乳酸化与RNA甲基化之间可能存在某种形式的相互作用，为理解基因表达的复杂调控网络提供了新视角。

◆组蛋白乳酸化和RNA甲基化修饰的联合思路主要有两种方向：

1. 组蛋白乳酸化影响RNA甲基化相关的调控蛋白（诸如甲基转移酶、去甲基转移酶和阅读蛋白）的表达水平，然后调控蛋白又进一步影响相应的RNA甲基化修饰水平，进而影响相应的表型；

2. RNA甲基化相关调控蛋白影响糖酵解代谢相关酶（比如醛缩酶和烯醇化酶1）的表达水平，进而影响乳酸的产量，进而影响组蛋白乳酸化水平，最后影响相应的生物学功能。

我们再来看看具体的案例。

思路一：

组蛋白乳酸化——RNA甲基化调控蛋白——RNA甲基化修饰

• 案例1: 组蛋白乳酸化促进的ALKBH3通过SP100A的m1A去甲基化促进肿瘤进展并减少早幼粒细胞白血病蛋白核缩合物[1]

• 研究单位：上海交通大学医学院附属第九人民医院

• 样本类型：人眼黑色素瘤组织

• 发表期刊：Nucleic Acids Res（IF=16.6）

• 发表时间：2024

• 研究对象：H3K18la+m1A

• 研究技术：ChIP-seq，CUT&Tag，WB，免疫荧光等

• 研究内容：

尽管N1-甲基腺苷（m1A）RNA修饰是RNA代谢的重要调节因子，但m1A修饰在癌症发生中的作用仍然不明。在这里，研究发现组蛋白乳酸化增强了ALKBH3的表达，同时通过去除SP100A的m1A甲基化减弱了肿瘤抑制性前髓细胞白血病蛋白（P