转录组+代谢组联合分析
简介
转录组是获得生物体内基因表达的重要方法,代谢组是生物体表型的基础和直接体现者。 转录组测序可以得到大量差异表达基因和调控代谢通路,但由于基因与表型之间很难之间关联,导致关键的信号通路难以确定,因此往往达不到预期的研究目的。代谢产物是生物体在内外调控下基因转录的最终结果,是生物体表型的物质基础。
在系统生物学研究时代,生物过程复杂多变,基因调控网络复杂。针对特定的生理、病理等表型进行研究,利用转录组的数据获得大量差异表达的基因,与代谢组检测得到的差异代谢物进行关联分析,从而从原因和结果两个层次对生物体的内在变化进行分析,鉴定关键基因靶点、代谢物及代谢通路,构建核心调控网络,系统全面地解析疾病发生发展的复杂机制,从整体上解释生物学问题。目前,转录组代谢组联合分析已被广泛用于各种疾病研究。
参考文献:
Yang K, et al. A Comprehensive Analysis of Metabolomics and Transcriptomics in Cervical Cancer[J]. Scientific Reports, 2017, 7:43353.