合并featurecount产生的多个表达矩阵文件

import os
import pandas as pd

# 设置文件路径
file_paths = [
    "F:\\Desktop\\daily_project\\pycharm_project\\",
    "F:\\Desktop\\daily_project\\pycharm_project\\",
    "F:\\Desktop\\daily_project\\pycharm_project\\"
   #这里填写绝对路径,并且一定要加上反义字符\
]

# 读取并合并 featureCounts 文件
dfs = []
for file_path in file_paths:
    # 打印文件路径以确保正确
    print(f"Processing file: {file_path}")

    # 读取文件时只选择 Geneid 和最后一列(计数列)
    df = pd.read_csv(file_path, sep='\t', comment='#')

    # 获取最后一列的列名(计数列)
    count_col = df.columns[-1]

    # 重命名列以方便合并
    df = df[['Geneid', count_col]]
    df.columns = ['Geneid', os.path.basename(file_path).replace('.count', '')]

    dfs.append(df)

# 合并所有数据框
merged_df = dfs[0]
for df in dfs[1:]:
    merged_df = pd.merge(merged_df, df, on='Geneid')

# 保存合并结果
output_path = "F:\\Desktop\\daily_project\\pycharm_project\\featurecounts_merge\\merged_counts.txt"
merged_df.to_csv(output_path, sep='\t', index=False)
print(f"Merged file saved to: {output_path}")

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### 回答1: 当然,以下是读取shp文件的C代码示例: ``` #include <stdio.h> #include <stdlib.h> typedef struct { double x; double y; } Point; typedef struct { int shape_type; double minx; double miny; double maxx; double maxy; int num_parts; int num_points; int* parts; Point* points; } Shape; void read_shapefile(const char* filename) { FILE* fp = fopen(filename, "rb"); if (fp == NULL) { printf("Unable to open file %s\n", filename); return; } // 读取文件头 int file_code, unused1, unused2, unused3, unused4, unused5, file_length; fread(&file_code, sizeof(int), 1, fp); fread(&unused1, sizeof(int), 5, fp); fread(&file_length, sizeof(int), 1, fp); fread(&unused2, sizeof(int), 1, fp); fread(&unused3, sizeof(int), 1, fp); fread(&unused4, sizeof(int), 5, fp); // 读取记录头 int record_number, record_length, shape_type; double minx, miny, maxx, maxy; int num_parts, num_points; int* parts; Point* points; while (fread(&record_number, sizeof(int), 1, fp) > 0) { fread(&record_length, sizeof(int), 1, fp); fread(&shape_type, sizeof(int), 1, fp); fread(&minx, sizeof(double), 1, fp); fread(&miny, sizeof(double), 1, fp); fread(&maxx, sizeof(double), 1, fp); fread(&maxy, sizeof(double), 1, fp); fread(&num_parts, sizeof(int), 1, fp); fread(&num_points, sizeof(int), 1, fp); parts = (int*) malloc(sizeof(int) * num_parts); points = (Point*) malloc(sizeof(Point) * num_points); fread(parts, sizeof(int), num_parts, fp); for (int i = 0; i < num_points; i++) { double x, y; fread(&x, sizeof(double), 1, fp); fread(&y, sizeof(double), 1, fp); points[i].x = x; points[i].y = y; } Shape shape = { shape_type, minx, miny, maxx, maxy, num_parts, num_points, parts, points }; // 处理当前记录的形状 free(parts); free(points); } fclose(fp); } int main() { read_shapefile("example.shp"); return 0; } ``` 上述代码使用C语言实现了读取shp文件的功能。读取的过程可以分为两个步骤:首先读取文件头,然后循环读取每个记录的头部和内容。 在循环中,代码读取记录头信息,包括记录编号、记录长度、形状类型、坐标范围等,然后读取记录内容,包括分段信息和点信息。最后,代码构造一个形状结构体,并处理当前记录的形状。需要注意的是,在处理完成一个记录后,需要释放 ### 回答2: 以下是一个读取shp文件的C++代码示例: ```cpp #include <iostream> #include "shapefile.h" int main() { // 打开shp文件 SHPHandle hSHP = SHPOpen("test.shp", "rb"); if (hSHP == NULL) { std::cout << "无法打开shp文件" << std::endl; return -1; } // 获取图层数量 int nLayers; SHPGetInfo(hSHP, NULL, &nLayers, NULL, NULL); // 遍历每个图层 for (int i = 0; i < nLayers; i++) { // 获取当前图层句柄 SHPHandle hLayer = SHPReadObject(i); // 获取当前图层的要素数量 int nEntities; SHPGetInfo(hLayer, &nEntities, NULL, NULL, NULL); // 遍历每个要素 for (int j = 0; j < nEntities; j++) { // 读取当前要素 SHPObject* pObject = SHPReadObject(hLayer, j); // 输出当前要素的坐标信息 for (int k = 0; k < pObject->nVertices; k++) { std::cout << "X坐标:" << pObject->padfX[k] << ",Y坐标:" << pObject->padfY[k] << std::endl; } // 释放当前要素内存 SHPDestroyObject(pObject); } // 关闭当前图层 SHPClose(hLayer); } // 关闭shp文件 SHPClose(hSHP); return 0; } ``` 上述代码使用shapefile.h头文件提供的函数来打开、读取和关闭shp文件。通过遍历每个图层和每个要素,可以获取shp文件中所有要素的坐标信息。该示例代码仅提供了基本的读取操作,根据自己的需求可以进行扩展和修改。 ### 回答3: 当读取shp文件时,我们可以使用C语言中的GDAL库来实现。GDAL是一个开源的地理数据抽象库,它提供了用于读取和处理地理空间数据的函数和工具。 首先,需要安装GDAL库并在代码中引入相关头文件。在读取shp文件之前,我们需要先打开文件,来获取文件的相关信息。 ```c #include <gdal.h> int main() { GDALAllRegister(); // 注册所有格式的驱动 GDALDatasetH hDataset; // 文件句柄 GDALDriverH hDriver; // 驱动句柄 OGRDataSourceH hDS; // 数据源句柄 OGRLayerH hLayer; // 图层句柄 OGRFeatureDefnH hFDefn; // 要素定义句柄 OGRFeatureH hFeature; // 要素句柄 OGRGeometryH hGeometry; // 几何体句柄 // 打开shp文件 hDataset = GDALOpenEx("path/to/your/shpfile.shp", GDAL_OF_VECTOR, NULL, NULL, NULL); if (hDataset == NULL) { printf("Open shp file failed!\n"); return -1; } // 获取数据源和图层 hDriver = GDALGetDatasetDriver(hDataset); hDS = GDALOpenEx("path/to/your/shpfile.shp", GDAL_OF_VECTOR, NULL, NULL, NULL); hLayer = OGR_DS_GetLayer(hDS, 0); // 获取要素定义 hFDefn = OGR_L_GetLayerDefn(hLayer); int featureCount = OGR_L_GetFeatureCount(hLayer, TRUE); printf("Feature count: %d\n", featureCount); // 循环读取要素 OGR_L_ResetReading(hLayer); while ((hFeature = OGR_L_GetNextFeature(hLayer)) != NULL) { // 获取几何体 hGeometry = OGR_F_GetGeometryRef(hFeature); if (hGeometry != NULL && wkbFlatten(OGR_G_GetGeometryType(hGeometry)) == wkbPolygon) { // 处理多边形几何体 // ... } // 释放要素 OGR_F_Destroy(hFeature); } // 关闭文件 GDALClose(hDataset); return 0; } ``` 上述代码中,我们首先调用`GDALAllRegister()`注册所有格式的驱动。接下来,通过`GDALOpenEx`函数打开shp文件,返回文件句柄`hDataset`。然后,我们可以通过`GDALGetDatasetDriver`函数获取驱动句柄,通过`OGR_DS_GetLayer`函数获取图层句柄。 在获取图层句柄后,我们可以通过`OGR_L_GetLayerDefn`函数获取图层的要素定义,并通过`OGR_L_GetNextFeature`函数循环读取要素。每个要素包含一个几何体,我们可以通过`OGR_F_GetGeometryRef`函数获取几何体句柄。 读取完要素后,记得通过`OGR_F_Destroy`函数释放要素内存。最后,使用`GDALClose`函数关闭文件。 这就是一个简单的使用C语言读取shp文件的示例。当然,实际应用中还可以根据需要进行更复杂的处理和分析。

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