用Excel画差异代谢物和差异表达基因的共富集图

本文介绍了如何在Excel中整合转录组和代谢组的KEGG富集结果,通过簇状柱形图展示共富集通路,包括数据准备、图形制作、PPT完善和双柱状图变形的步骤,以及如何导出矢量图以确保清晰度。

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                                                              ◆   背   景   ◆  

多组学策略已成为生物研究中的一种重要手段,从多个层次解析表型变化的内在机制。其中,转录组+代谢组是应用最广泛的,寻找差异积累代谢物(DAMs)和差异表达基因(DEGs)的共富集通路是转录组和代谢组整合分析的一项重要内容,一张好的图能方便读者阅览全部的富集结果和快速辨认关键的富集通路。今天教大学如何用Excel绘制共富集图。

◆   第一步:准备转录组和代谢组的KEGG富集结果。将它们放在同一张表格中,提前将富集的Pvalue值转换为-log10(Pvalue),参考下图:

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◆   第二步:画图

2.1 选中数据-插入-图表-二维柱形图-簇状柱形图,就出现两列的图形。

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2.2 删掉图表标题,去掉方格线,暂时去掉图例,将图的高度和宽度拉大。

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2.3 添加横纵坐标轴。选中坐标,从右侧的设置坐标轴格式-坐标轴选项-刻度线-主刻度线类型(J)-外部。另外将填充与线条-线条-颜色(设置为黑色)-

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