空间转录组 | 华大Stereo-seq在肿瘤研究中的应用

癌症仍然是全球面临的重大健康挑战，随着测序技术的发展使我们能够更好地了解肿瘤中潜在的遗传和分子机制。其中单细胞测序一直作为解析其细胞异质性的关键技术而存在。但是单细胞测序缺乏相应的空间背景信息，且如果想要解析肿瘤免疫微环境，空间背景信息必不可少。在此背景下，空间转录组测序技术应运而生，能够将细胞转录组信息与组织内的空间坐标整合在一起，深入了解不同细胞类型之间的相互作用以及整体组织结构，成为阐明癌细胞异质性和组织内空间分布的理想方法。

Stereo-seq时空组学技术作为一种基于 DNA 纳米球 (DNB) 模式阵列的全基因组技术与其他空间转录组技术相比，实现了500nm的分辨率，成为全球首个同时实现“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”的技术，且实现了基因与影像同时分析。到目前为止，Stereo-seq在癌症研究领域已发表多篇文章，今天我们就一起来看一下吧。

01.Stereo-seq助力展现肝细胞癌“癌-胚”细胞类群的空间共定位关系

• 期     刊：Nature Cancer

• 影响因子：22.7

• 发表时间：2024年1月2日

• 发表单位：上海市免疫学研究所、澳大利亚科廷大学、新加坡国家癌症中心、华大生命科学研究院等

肿瘤生态系统的癌-胚重编程诱导肿瘤微环境中的胎儿发育特征，导致免疫抑制特征。在该研究中，作者首