VESTA官方手册 | 第十章：定义绘图边界和视图方向

第十章 定义绘图边界和视图方向

10.1 绘图边界

可通过选择侧边栏上的Boundary按钮，或从菜单栏中选择Objects | Boundary…，改变绘图边界的尺寸（盒子）。将打开Boundary对话框，如图10.1所示。该对话框也可以通过键盘快捷键<Ctrl> + <Shift> + <B>打开。在该对话框的上方，选择所要编辑的相。单击OK或Apply按钮，可在图形区域中查看编辑效果。

改变边界将重新生成图形区域中的所有原子，并将对象的所有属性重置为默认值。原子、化学键和多面体的选定或隐藏状态被重置为默认状态。

图10.1：Boundary对话框

10.1.1 分数坐标的范围

绘图边界是通过输入沿x、y和z轴的分数坐标范围设置的

图10.2：通过同步辐射X射线粉末衍射数据，利用最大熵方法测定的D-山梨醇的电子密度分布。使用截止平面( 1 1 0 )在( 0 , 0 , 0 )到( 1 , 1 , 1 )范围内绘制

10.1.2 截止平面

除了分数坐标的范围，还可以进一步设置“截止平面”，如图10.2所示。在生成了x、y和z范围内的原子、化学键和等值面之后，那些位于截止平面之外的原子被排除在外。虽然原子、化学键和多面体可以通过11.4节中描述的另一种方式隐藏，但这是去除部分等值面和切面的唯一方法。因此，这一功能对于等值面和晶格平面上体数据二维分布的可视化十分有效。每个截止平面以米勒指数hkl和距离原点( 0 , 0 , 0 )的距离设置。截止平面离原点的距离可以用它的晶面间距d或Å为单位设置。

当勾选了Apply symmetry operations选项时，所有对称等效的米勒面都将作为截止平面（图10.3）。若要使用选定的原子定义截止平面，可在图形区域中选择三个或更多原子，然后按Calculate the best plane for the selected atoms按钮。

Cutoff planes框中，列出了截止平面。当未在列表选择截止平面时，一些按钮和文本框将被禁用。在选择列表中的项时，文本框将更新，显示与所选截止平面相关的数据。要添加一个新的截止平面，首先单击New按钮，然后输入米勒指数、hkl和到原点的距离。如要删除截止平面，在列表中选择一项，然后单击Delete按钮，或者按下键盘上的Delete键。单击Clear按钮，将删除列表中所有的截止平面。

图10.3：在从(-8, -8, -8) 到 (8, 8, 8)范围，存在和不存在{1 1 1}截止平面的情况下绘制的金刚石晶体结构。绘图边界以透明面显示

10.2 视图方向

可通过选择侧边栏上的Orientation按钮，或从菜单栏中选择Objects | Orientation…，设置观察对象的方向。将打开Orientation对话框，如图10.4所示。该对话框也可以通过键盘快捷键<Ctrl> + <Shift> + <O>打开。在该对话框的上方，选择所要应用观察方向的相。如要改变每个相的相对方向，可使用Edit Data对话框中的Phase选项卡（见第七章）。

图10.4：Orientation对话框

10.2.1 设置方向的方式

垂直晶格平面( hkl )的晶格矢量[ uvw ]或倒易晶格矢量[ hkl ]*可指定为投影方向

▪Project along [uvw]：投影沿晶格矢量[uvw]

投影方向为晶格矢量ua + vb + wc。

▪Project along the normal to (hkl)：投影沿(hkl)法向

投影方向为倒易晶格矢量ha* + kb* + lc*。

10.2.2 方向矩阵

显示一个当前方向的3×3旋转矩阵。

10.2.3 视图方向

两个方向，即投影方向（从视点到屏幕的方向）和屏幕的向上方向，由一组晶格矢量和倒格矢指定。这两个矢量互相垂直。当晶格矢量ua + vb + wc位于( hkl )平面时，u，v，w，h，k，l必须满足条件：

因此，为了指定屏幕的向上方向，必须满足这个条件，否则屏幕的向上方向由VESTA自动确定。

▪Projection vector投影向量：投影方向。

在Project along [uvw]模式中，该向量是ua + vb + wc中的u，v，w。

在Project along the normal to (hkl) plane模式中，该向量是ha* + kb* + lc*中的h，k，l。

▪Upward vector向上方向向量：屏幕的向上方向。

在Project along [uvw]模式中，该向量是ha* + kb* + lc*中的h，k，l。在Project along the normal to (hkl) plane模式中，该向量是ua + vb + wc中的u，v，w。10.2.4 沿晶轴观察结构

要沿单位晶胞或倒易晶格的基矢查看图形区域中的结构，只需按下水平工具栏中的上述按钮之一。当两个或多个相在同一图形区域内显示时，上述按钮设置相对于第一个相的观察方向。若要设置相对于第一个相以外的另一个相的观测方向，可使用Orientation对话框。