纯干货:差分电荷密度 | VASP零基础实用教程

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前面的教程介绍了VASP的输入文件的准备和输出文件的解读,以及建立模型的方法,相信大家通过结合前面的教程并不断地练习一定可以很快的掌握VASP计算的基本技能。接下来我们将通过三章教程来讲解一下电荷方面的计算教程。本章教程先来讲解一下如何计算差分电荷密度
差分电荷密度(charge density difference)通常是用来分析成键的过程或是结构弛豫前后电荷的转移,当然,也有人用来分析基态和激发态的电荷分布差别等情况。下面我们来介绍一下如何计算差分电荷密度。 计算差分电荷密度需要基于优化后的结构,我们以CO吸附在Pt (111)表面的体系为例子来讲解一下差分电荷密度的计算过程。整个差分电荷密度的计算的过程需要以优化好的CO/Pt体系为基础,计算公式如下。
Δρ=ΔρCO/Pt-ΔρCO-ΔρPt
我们需要分别计算CO/Pt,CO和Pt的电荷密度。CO/Pt的电荷密度直接以结构优化后的结构为基础进行计算得到CHGCAR文件。对于CO和Pt的坐标,直接通过优化后的CO/Pt结构文件获得,分别进行静态计算得到CHGCAR文件。
这样上述计算公式所需的各项参数就已经齐全了,接下来说一下如何处理数据得到差分电荷密度图。
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我们需要通过VESTA软件来获得差分电荷密度图。首先打开VESTA软件,打开CO/Pt的CHGCAR文件,这样就打开的总的电荷密度。
接下来我们需要将从总的电荷密度中将CO和Pt的电荷减掉,就可以观察到CO与Pt (111)之间的电荷传输,具体操作过程如下。依次点选Edit->Edit Data ->Volumetric Data…然后在弹出的对话框中点选Import,选择CO和Pt的CHGCAR文件,选择open,既可以导入CHGCAR文件,接下来的窗口可以选择对导入的文件做何种操作(加或者减),以及选择数据的单位。
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这里选择“Subtract from current data”,
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数值单位我一般选择“Raw Data”,上述操作之后点击OK即可。这时已经将CO和Pt的电荷从CO/Pt总电荷里面减去,对图像进行设置就可以得到差分电荷密度图。 点选Properties即可对isosurface进行设置,包括大小,颜色等。设置好这些参数之后,就可以将图片导出,依次点选File->Export Raster Image…选择图片格式即可,这样我们就得到了CO/Pt体系的差分电荷密度了。
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计算二氧化钛的分态密度可以使用VASP软件,下面是详细的步骤: 1. 准备输入文件 在计算二氧化钛的分态密度之前,需要准备好输入文件。VASP需要POSCAR文件(体系的晶体结构)和INCAR文件(计算参数)。其中,POSCAR文件可以通过其他软件生成,比如Materials Studio、Vesta等;而INCAR文件需要自己编辑。 2. 编辑INCAR文件 编辑INCAR文件,设置计算参数。以下是建议的一些参数: ``` ISTART = 0 ICHARG = 2 ENCUT = 500 eV ISMEAR = -5 SIGMA = 0.05 ISPIN = 2 LORBIT = 11 LWAVE = .TRUE. LCHARG = .FALSE. NEDOS = 2001 ``` 其中,`ISTART`表示是否从上一次计算的结果继续计算,这里设置为0表示从头开始计算;`ICHARG`表示电荷密度的初始化方式,2表示从CHGCAR文件中读取;`ENCUT`表示平面波截断能;`ISMEAR`表示电子分布的平滑方式,-5表示使用tetrahedron方法;`SIGMA`表示用于ISMEAR的sigma值;`ISPIN`表示自旋极化,2表示自旋极化计算;`LORBIT`表示是否输出能带信息,11表示输出投影到原子轨道的态密度信息;`LWAVE`表示是否输出波函数信息;`LCHARG`表示是否输出电荷密度信息;`NEDOS`表示态密度的能量网格点数。 3. 运行计算 将输入文件和INCAR文件放到同一目录下,然后使用命令运行计算: ``` mpirun -np 16 vasp_std ``` 其中,16是并行计算的进程数,可以根据自己的计算机配置进行调整。 4. 后处理 计算结束后,可以使用VASP自带的工具进行后处理。比如,使用PROCAR文件计算各个原子轨道的态密度,使用DOSCAR文件计算总的态密度。 以上就是使用VASP计算二氧化钛分态密度的详细步骤,希望对你有帮助!
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