Med-BERT - 预训练教程

最新推荐文章于 2025-02-20 11:33:33 发布
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分类专栏： AI+医疗 # KG图神经网络GNN、GCN、GCT 文章标签： bert 人工智能 深度学习
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【论文解读】Med-BERT: 用于疾病预测的大规模结构化电子健康记录的预训练情境化嵌入
小哲的博客
10-31 550
Med-BERT 是一种基于预训练的语义模型，它是在BERT的基础上进行了修改，专门用于处理结构化的电子健康记录（EHR）数据。Med-BERT 的架构由两个部分组成：Med-BERT 和预测头。其中，Med-BERT 部分的参数被加载并初始化自预训练模型，而预测头的参数则在微调过程中更新。Med-BERT 使用了六个层、六个注意力头和一个隐藏维度为192的变压器架构。在预训练阶段，Max Sequence Length 被设置为512个标记。
[论文解读]CPLLM：使用大型语言模型进行临床预测CPLLM: Clinical Prediction with Large Language Models 数据集eICU、MIMIC 3等EHR数
强化学习曾小健
03-17 1809
我们提出了使用大语言模型进行临床预测（CPLLM），这是一种对预先训练的大语言模型（大语言模型）进行微调以进行临床疾病预测的方法。我们利用量化并根据提示对大语言模型进行微调，其任务是利用患者的历史诊断记录来预测患者在下次就诊或随后的诊断中是否会被诊断出目标疾病。我们将我们的结果与各种基线进行了比较，包括Logistic 回归、RETAIN 和 Med-BERT，这是使用结构化 EHR 数据进行疾病预测的当前最先进的模型。
一文详解大模型训练全过程
最新发布
kaka0722ww的博客
02-20 1676
Transformer架构是现代大规模预训练模型（如GPT、BERT等）的核心基础。它主要由注意力机制（attention）和前馈神经网络（Feed - forward Network）构成。自注意力机制（Self - attention）：自注意力机制使得模型在处理每个token时，可以“关注”输入序列中其他位置的token，从而捕捉到长距离的依赖关系。多头注意力（Multi - head Attention）：将多个注意力头组合起来，模型能够在不同的子空间中捕捉到多种不同的依赖关系。前馈神经网络。
medical_bert.zip
10-14
中文医学百万问答对数据训练字粒度的bert预训练语言模型
MedBERT：医疗领域的预训练语言模型
gitblog_00089的博客
04-04 1582
MedBERT：医疗领域的预训练语言模型 项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/me/medbert 项目简介 是一个基于BERT（Bidirectional Encoder Representations from Transformers）的预训练模型，专为生物医学领域定制。该项目的目标是提升自然语言处理在医疗文本理解、信息提取等任务中的性能，使AI更有效地协...
医疗领域Bert模型比较
baiye
07-24 5403
医疗领域的Bert模型 chineseEHRBert 论文 无 类型 中文电子病历的预训练模型 数据量 100G+ 数据类型 医院的非公开数据 结果 比对结果没有出 预备是与原始BERT进行比对 不能跑 BioBert 类型 生物医学文本挖掘的预训练语言表示模型 数据集 英文生物医学相关数据集 形式 已经成为可以直接调用的工具 K-Bert 论文 AAAI 2020 研究者 北大+腾讯 类型 在特定领域的任务(包括金融、法律和医学)中，K-BERT的表现明显优于BERT，这表明K-BERT是解决需要专家
Med-BERT：基于电子健康记录的疾病预测模型
gitblog_00607的博客
09-08 1114
Med-BERT：基于电子健康记录的疾病预测模型 项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/me/Med-BERT 项目介绍 Med-BERT 是一个基于 BERT 框架的上下文嵌入模型，专门针对电子健康记录（EHR）中的诊断代码进行预训练。该项目通过使用包含 28,490,650 名患者的结构化 EHR 数据，主要针对 ICD-9 和 ICD-10 格式的诊断代码进...
BERT从零详细解读：如何做预训练 - MLM+NSP
热门推荐
weixin_40064300的博客
04-24 1万+
MLM: mask language model NSP: 去判断两个句子之间的关系 BERT在预训练时使用的是大量的无标注的语料（比如随手可见的一些文本，它是没有标注的）。所以它在预训练任务设计的时候，一定是要考虑无监督来做，因为是没有标签的。 对于无监督的目标函数来讲，有两组目标函数比较受到重视， 第一种是 AR模型，auto regressive，自回归模型。只能考虑单侧信息，典型的就是GPT。 另一种是AE模型，auto encoding，自编码模型。从损坏的输入数据中预测重建原始数据，可以使用上下
人工智能|预训练大模型——全球医疗大模型
也许有一天我们再相逢 睁开眼睛看清楚 我才是英雄！
09-17 3105
谷歌和DeepMind的科研人员在《自然》杂志上发表了一项研究，根据其研究结果，一组临床医生对谷歌和DeepMind团队的医疗大模型Med-PaLM回答的评分高达92.6%，与现实中人类临床医生的水平（92.9%）相当。
ChatGLM-Med: 基于中文医学知识的ChatGLM模型微调.zip
06-24
1. **大语言模型**：大语言模型是一种深度学习模型，如BERT、GPT或T5，它们在大规模无标注文本数据上进行预训练，具备理解文本、生成语言以及解决各种自然语言处理任务的能力。ChatGLM是其中的一种，特别设计用于...
Python-BioBERT用于生物医学文本挖掘的预先训练生物医学语言表示模型
08-10
BioBERT: 用于生物医学文本挖掘的预先训练生物医学语言表示模型
PubMed完全攻略
10-27
PubMed完全攻略 俗话说，喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网 生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知 道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢？ PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长，早的可 以追溯到20世纪60年代，通常而言，这已经足够早了，很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然，研究生物医学史 的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文 献摘要，而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时 间，但借助于PubMed，我们仍旧可以随时掌握最新的动向，从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商 通过PubMed提供文献的全文，有时甚至是免费的，这样，我们就可以在PubMed上真正享受"坐拥书城"的感觉了（关 于如何获取全文将在以后的章节中详述）。
推荐开源项目：临床BERT（ClinicalBERT）
gitblog_00033的博客
05-09 908
推荐开源项目：临床BERT（ClinicalBERT） 去发现同类优质开源项目:https://gitcode.com/ 项目介绍 临床BERT是一款专为处理临床笔记数据设计的预训练模型，它提供了上下文相关的表示方法，可以深入理解和解析医疗领域的复杂文本信息。该项目不仅包含了预训练和微调的权重，还提供了一系列脚本供用户轻松进行模型部署和应用。 项目技术分析 基于PyTorch的临床BERT利用了T...
MedBERT 开源项目使用教程
gitblog_00230的博客
09-14 794
MedBERT 开源项目使用教程 medbert 本项目开源硕士毕业论文“BERT模型在中文临床自然语言处理中的 应用探索与研究”相关模型 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/me/medbe...
迁移学习导论-cap8：预训练方法
xu.hyj
03-18 1207
1、为什么能够使用预训练？ 一种观察现象：假设一网络的输入是一只狗，在网络的最初几层，网络只能检测一些边边角角的低级特征；到了中间的层，网络可能会检测到一些线条和圆形，比边边角角特征更明显；到了较深层，网络能够提炼代表狗的高级特征，比如腿、脸等。 对于这种观察到的现象，一种广泛接受的解释是：对于CNN，其渐层负责学习通用的特征（比如边、角等），深层负责学习与任务相关的特殊特征（腿、脸等）。随着层次的加深，网络渐渐从通用特征过渡到特殊特征的学习表征。 由上可知，既然浅层是与任务无关的，而高层是与任务相关的，
预训练（Pre-training），人工智能领域的预训练是什么——AI教程
qq_26303031的博客
08-14 4019
预训练是指在一个大规模的通用数据集上对模型进行初步训练，使其能够学习到丰富的特征表示。这个过程通常在没有监督（即没有明确的标签）的情况下进行，称为无监督预训练。经过预训练的模型可以捕捉到数据中的模式和结构，从而在后续的特定任务（如分类、回归等）中更有效地进行微调（fine-tuning）。
2021年如何科学的“微调”预训练模型
发现问题，并解决问题，批判性思维
11-27 1546
文章目录一、前言二、什么是“微调”Fine-tune？三、预训练模型和常见NLP训练任务四、“微调”预训练模型五、结语Reference 本文转自AI部落公众号。仅用于学习。 一、前言 2021年，深度学习领域，无论是自然语言处理、音频信号处理、图像处理、推荐系统，似乎都看到attention混得风生水起，只不过更多时候看到的是它的另一个代号：Transformer。 大部分深度学习的同学除了在各大paper里看到Transformer，平常与Transformer打交道最多的时候，大概率都是在用一个叫做：
探索中文临床自然语言处理的利器：MedBERT
gitblog_00189的博客
09-14 682
探索中文临床自然语言处理的利器：MedBERT 项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/me/medbert 项目介绍 MedBERT 是一个开源的中文临床自然语言处理（NLP）模型，源自硕士毕业论文“BERT模型在中文临床自然语言处理中的应用探索与研究”。该项目不仅提供了预训练的MedBERT和MedAlbert模型，还构建了多个中文医学相关的数据集，为中文临床N...
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